Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms