Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms