Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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