Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pggt1bQ8BUY9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pggt1bQ8BUY9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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