Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop53Q8BK35 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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