Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms