Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms