Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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