Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms