Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GcsamQ6RFH4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms