Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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