Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Krt77Q6IFZ6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt77Q6IFZ6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms