Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Frem1Q684R7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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