Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 375.1 ms