Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sema3cQ62181 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms