Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BcanQ61361 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BcanQ61361 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BcanQ61361 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BcanQ61361 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BcanQ61361 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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BcanQ61361 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BcanQ61361 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BcanQ61361 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BcanQ61361 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BcanQ61361 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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