Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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