Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms