Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Traf3Q60803 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Traf3Q60803 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Traf3Q60803 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Traf3Q60803 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Traf3Q60803 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms