Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms