Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms