Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm29609Q3UU56 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm29609Q3UU56 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm29609Q3UU56 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm29609Q3UU56 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm29609Q3UU56 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm29609Q3UU56 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm29609Q3UU56 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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