Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BB287469Q3UT53 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms