Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6899Q3USS0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm6899Q3USS0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms