Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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