Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms