Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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