Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb38Q3LR78 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb38Q3LR78 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms