Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Traf3ip1Q149C2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms