Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrriq1Q0P5X1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms