Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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