Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb4Q02738 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.1 ms