Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde4dQ01063 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms