Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp1P97350 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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