Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms