Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms