Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms