Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd38P56528 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms