Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SrprbP47758 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SrprbP47758 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms