Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11bP46638 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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