Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18530 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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P18530 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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P18530 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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P18530 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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P18530 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18530 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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P18530 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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P18530 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18530 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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