Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18526 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18526 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18526 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms