Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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