Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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