Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DmdP11531 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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DmdP11531 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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DmdP11531 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DmdP11531 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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DmdP11531 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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DmdP11531 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DmdP11531 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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