Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01654 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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P01654 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01654 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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