Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cops6O88545 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cops6O88545 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cops6O88545 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cops6O88545 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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