Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms