Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ptpn20O55082 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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