Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clk2O35491 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms